خدمات بیوانفورماتیک مرتبط با پروتئین
تحقیقات و بررسی های بیوانفورماتیکی در دنیای زیست شناسی امروز جزئی جدایی ناپذیر به شمار می آیند. با توجه به حجم عظیم داده های تولید شده در دوره ی پساژنومیک استفاده از روش ها و ایزارهای بیوانفورماتیکی برای درک و تحلیل داده های زیستی امری اجتناب ناپذیر می باشد. در این راستا شرکت DNAقصد دارد با استفاده از نیروهای متخصص در زمینه ی مطالعات بیوانفورماتیک خدماتی را به جامعه ی علمی کشور ارائه دهدو تا گامی در جهت پیشبرد اهداف علمی کشور و محققین برداشته باشد.
در زمینه ی مطالعاتی که پروتئین ها مورد بررسی قرار می گیرند شرکت DNA قادر به ارایه ی خدمات زیر می باشد:
- به دست آوردن توالی مرجع پروتئینی
- انجام انواع BLAST پروتئینی
- انجام انواع همردیفی های پروتئینی
- بررسیconservancy همردیفی
- ترسیم درخت فیلوژنیک
- پیش بینی ویژگی های فیزیکوشیمیایی پروتئین
- طراحی پروتئن های فیوژن و نوترکیب
- پیش بینی ساختار دوم پروتئین
- مدلینگ ساختار سه بعدی پروتئین با استفاده از رویکردهای
- Homology modeling
- Threading method
- Ab initio
- بهینه سازی مدل های سه بعدی پروتئینی
- Energy minimization
- Loop modeling
- Model refinement softwares
- تعیین کیفیت مدل های سه بعدی پروتئینی
- پیش بینی تغییرات پس از ترجمه
- N-glycosilation
- O-glycisilation
- Phosphorylation
- Ubiquitination
- SUMOylation
- Sulfinator
- Prenylation
- Palmitoylation
- Methylation
- GPI-anchor
- پیش بینی localization پروتیین
- داکینگ protein-ligand و protein-protein
- Autodock
- Autodock vina
- شناسایی کاندید های ممانعت کننده و دارو از طریق virtual screening
- Pyrex
- Molegro
- انجام بررسی های molecular dynamics در حد nanosecond
- بررسی نواحی disorder
- بررسی قابلیت folding
- بررسی قابلیت aggregation
این سرویس توسط شرکت دیبا نوآوران آزما (ِDNA Biotech Co) انجام میپذیرد. جهت صدور پیش فاکتور متناسب با خدمات مورد نظر، درخواست خود را به dnabiotechco@gmail.com ارسال فرمایید.
نظرات کاربران